whole-genome sequencing suggest the global diversification of pathogen

Shigella sonnei genome sequencing and phylogenetic analysis indicate recent global dissemination from Europe

We report here whole-genome sequencing of 132 globallydistributed isolates. Our phylogenetic analysis shows that the current S. sonnei population descends from a common ancestor that existed less than 500 years ago and that diversified into several distinct lineages with unique characteristics. Our analysis suggests that the majority of this diversification occurred in Europe and was followed by more recent establishment of local pathogen populations on other continents, predominantly due to the pandemic spread of a single, rapidly evolving, multidrug-resistant lineage.